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生物工程实验室是澳门娱场城网址的专业基础实验室之一，成立于1997年1月，原称发酵工艺实验室，2001年12月，学校将其名称调整规范为生物工程实验室。其主要承担的实验教学任务为：生物工程专业、植物科学技术专业和生物科学专业的基础实验课教学，部分本科生和研究生的毕业论文实验以及生物工程专业部分科研工作。实验室主任为杨生玉教授。

实验室现有专任教师18人，其中教授5人，副教授9人，高级实验师1人，实验师2人，其中有博士学位教师11人。实验室已拥有科研用房1200平方米，建成了微生物发酵、资源微生物技术等基础条件平台，设备总值达1699万元。

近5年，实验室顺利完成本专业的所有实验教学任务。在科研方面，实验室围绕微生物发酵关键技术、微生物代谢与调控等研究方向开展工作，承担有省级以上项目24项，其中国家自然科学基金6项，省科技厅项目15项，横向研究项目2项，成果转化1项；发表核心期刊论文30多篇，其中SCI论文9篇；授权专利5项；获得厅级科技成果奖1项。多个应用成果获得转让，建立了澳门娱场城网址双创教育实践基地—精酿啤酒工作室，受到国内外同行的关注。